南华大学病原学实验中心组建于1998年，由医学微生物学实验室、医学免疫学实验室和人体寄生虫学实验室合并而成。1999年通过湖南省普通高等学校“双基”实验室合格评估，成为省级“合格实验室”， 2003年被列为“中央与地方共建高校实验室”，2006年被列为“十一五湖南省普通高等学校基础课示范实验室”。目前承担了临床医学、麻醉学、医学影像学、口腔医学、医学检验技术、药学、药物制剂、预防医学、卫生检验与检疫、护理学等本科专业的《医学微生物学》、《医学免疫学》、《人体寄生虫学》、《临床寄生虫学与检验》、《微生物学》以及病原生物学与免疫学专业研究生的实验教学任务。中心现有专职实验技术人员7人，其中，高级实验师4人，实验师2人，助理实验师1人，在读博士1人，硕士3人。中心用房约740m2，拥有仪器配备先进的教学实验室7个，以及1个种类齐全、形态完整的寄生虫大体标本陈列室。仪器设备共计731台(件)，设备总价值264.5万元。
   中心以病原生物学科为依托，以“特殊病原体防控湖南省重点实验室”为平台，全体人员团结一致，开拓进取，在实验教学与科学研究方面取得了长足的进步。近5年来，中心老师主持国家自然科学基金5项，省、厅级科研项目9项，校级教研教改项目3项；以第一作者发表科研及教学论文50余篇，其中SCI收录论文9篇；主编或参编教材/专著6部。